2月6日，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)宣布發(fā)現(xiàn)穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主。

2月20日，管軼教授團(tuán)隊(duì)在生物預(yù)印本 bioRxiv 在線發(fā)表論文，從反走私行動(dòng)中查獲的多個(gè)穿山甲樣本進(jìn)行檢測(cè)，并在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)了新冠病毒相關(guān)冠狀病毒，屬于此次新冠病毒的兩個(gè)亞型，其中一個(gè)受體結(jié)合域與新冠病毒密切相關(guān)。隨后，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)的論文也在 bioRxiv 上線。詳情：還是穿山甲！管軼教授從被走私的穿山甲中發(fā)現(xiàn)新冠病毒

然而，這兩項(xiàng)研究并不能打消所有疑慮，也沒(méi)有直接確定性證據(jù)表明穿山甲就是此次新冠病毒的中間宿主。

近日，廣東省生物資源應(yīng)用研究所陳金平教授團(tuán)隊(duì)在生物預(yù)印本 bioRxiv 在線發(fā)表了一篇題為：Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) ?的研究論文。

論文指出，雖然穿山甲所攜帶的冠狀病毒的確與新冠病毒（SARS-CoV-2）有遺傳相關(guān)性，但卻可能不是本次疫情的中間宿主。

確定病毒中間宿主十分迫切

2019年12月，湖北武漢市爆發(fā)了一次原因不明的肺炎疫情（COVID-19），隨后，研究人員確定導(dǎo)致該疫情的病原體新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）。

為了有效防控疫情，科學(xué)家們迫切需要確定新冠病毒的真實(shí)中間宿主。由于華南海鮮市場(chǎng)上出售了大量各種野生動(dòng)物，所以，尚且未知哪種動(dòng)物是病毒的中間宿主。

冠狀病毒可引起呼吸道和胃腸道感染，除了SARS-CoV-2之外，冠狀病毒家族還包括引起2003年SARS疫情的SARS-CoV病毒和2012年引起中東呼吸綜合癥疫情的MERS-CoV病毒。

冠狀病毒含有大約3萬(wàn)個(gè)堿基組成的基因組，這些基因組編碼了多達(dá)11種蛋白質(zhì)，通過(guò)計(jì)算模型分析后發(fā)現(xiàn)，SARS-CoV和SARS-CoV-2病毒均把血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2（ACE2）作為與人體細(xì)胞結(jié)合的主要受體。

獲得穿山甲冠狀病毒的基因組序列

2019年3月，研究人員從廣東海關(guān)截獲了26只走私的馬來(lái)穿山甲中的3只樣本中檢測(cè)出了冠狀病毒的存在。

隨后，研究人員對(duì)這三只死亡的穿山甲收集了基因組測(cè)序樣本，并組合成了穿山甲冠狀病毒的基因組序列，即：pangolin-CoV-2020，該序列約有29380個(gè)核苷酸，約占病毒基因組的84％，如下圖所示。

值得注意的是，下表的基因組分析結(jié)果表明，穿山甲攜帶的pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2和蝙蝠身上的Bat-CoV-RaTG13都具有高度同源性。

此外，就病毒S蛋白的核苷酸序列同源性而言，pangolin-CoV-2020和SARS-CoV-2之間高達(dá)82.21％。

以上結(jié)果都表明，pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2以及SARS-CoV可以共享相同的受體ACE2。

如下圖所示，根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明，與冠狀病毒的其他成員相比，pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2和蝙蝠冠狀病毒（Bat-CoV-RaTG13）的S基因在遺傳上更加相似。

另外，系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)表明，蝙蝠身上的冠狀病毒（Bat-CoV-RaTG13）在基因組序列上都更接近SARS-CoV-2。

不能武斷穿山甲是中間宿主

有趣的是，研究人員發(fā)現(xiàn)，SARS-CoV-2的S1蛋白和S2蛋白之間有多個(gè)插入的PRRA短序列，這再次證實(shí)了科學(xué)家的猜測(cè)：在蝙蝠和人類之間很可能存在著另一個(gè)病毒中間宿主，也就是說(shuō)，此次新冠病毒并非由蝙蝠直接傳播給人類，而是經(jīng)過(guò)了一個(gè)中間宿主進(jìn)行的傳播。

冠狀病毒的S蛋白通過(guò)受體結(jié)合域與宿主受體結(jié)合，之前的研究表明，SARS-CoV-2、SARS-CoV和Bat-CoV-RaTG13具有相似的受體結(jié)合域，但是本文的分析結(jié)果表明，存在于穿山甲中的ACE2受體具有高度序列保守性，因此，尚不清楚pangolin-CoV-2020的人畜共患病情況。

最后，作者指出，本文的研究結(jié)果支持蝙蝠是SARS-CoV-2的起源，但是動(dòng)物源性冠狀病毒的宿主范圍是混雜的，在不清楚pangolin-CoV-2020的人畜共患病情況時(shí)，并不能武斷穿山甲就是SARS-CoV-2的中間宿主！